Lista de Ferramentas de Bioinformática
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;[http://www.expasy.org/ Expert Protein Analysis System] | ;[http://www.expasy.org/ Expert Protein Analysis System] | ||
− | ;[http:// | + | :ExPASy is the new SIB Bioinformatics Resource Portal which provides access to scientific databases and software tools in different areas of life sciences |
+ | ;[http://img.jgi.doe.gov/ Integrated Microbial Genomes System] | ||
+ | :The Integrated Microbial Genomes (IMG) is a genome browsing and annotation system | ||
;[http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_biological_databases List of biological databases] | ;[http://en.wikipedia.org/wiki/List_of_biological_databases List of biological databases] | ||
:Wiki com uma lista de banco de dados biológicos | :Wiki com uma lista de banco de dados biológicos | ||
;[http://intro-prog-bioinfo-2010.wikispaces.com/ Python Bioinformatics Course] | ;[http://intro-prog-bioinfo-2010.wikispaces.com/ Python Bioinformatics Course] | ||
;[http://gmod.org/wiki/Main_Page GMOD] | ;[http://gmod.org/wiki/Main_Page GMOD] | ||
+ | :GMOD is the Generic Model Organism Database project, a collection of open source software tools for creating and managing genome-scale biological databases | ||
;[http://www.phylogeny.fr/version2_cgi/index.cgi Phylogeny.fr] | ;[http://www.phylogeny.fr/version2_cgi/index.cgi Phylogeny.fr] | ||
:Ferramentas on-line de alinhamento e criação de árvores | :Ferramentas on-line de alinhamento e criação de árvores |
Edição de 13h46min de 31 de agosto de 2011
Tabela de conteúdo |
Aplicativos online e standalone
- Expert Protein Analysis System
- ExPASy is the new SIB Bioinformatics Resource Portal which provides access to scientific databases and software tools in different areas of life sciences
- Integrated Microbial Genomes System
- The Integrated Microbial Genomes (IMG) is a genome browsing and annotation system
- List of biological databases
- Wiki com uma lista de banco de dados biológicos
- Python Bioinformatics Course
- GMOD
- GMOD is the Generic Model Organism Database project, a collection of open source software tools for creating and managing genome-scale biological databases
- Phylogeny.fr
- Ferramentas on-line de alinhamento e criação de árvores
- iTol
- Interative Tree of Life
- t-Align
- Compara réplicas de T-RFLP
- ARB
- Orphelia
- Metagenomic ORF finder
- MEGA
- ModelTest
- Teste de modelos de alinhamento
- Spatial Analisys in Macroecology
- Sabia Metagenome
- Família Phylip de programas
- LabInfo LNCC
Análises de sequências e alinhamento
- Embl Tools
- NCBI Tools
- EsyPred3D
- Predição de estruturas protéicas 3D
- Bioperl
- Dependências BIO para PERL
- Blast NCBI Online
- Blast do NCBI
- CodonCode Aligner
- Clustal
- Alinhamento múltiplo de forma local
Análises metagenômicas
- MEGAN
- MEtaGenome ANalyzer
- JCVI Metarep
- Análises metagenômicas (necessita de sequencias anotadas)
- JCVI Manatee
- Software de anotação de sequências
- JCVI Annotation service
- Serviço de anotação de sequências
- JCoast
- GenDB
- MG-RAST
- The Metagenomics RAST (online)
- MegX
- Portal for marine ecological genomics
- JGI GEBA
- IMG GEBA
- NBC
- Naïve Bayesian Classification tool
- WebCarma (login)
- PhyolOTU
- A High-Throughput Procedure Quantifies Microbial Community Diversity and Resolves Novel Taxa from Metagenomic Data
- CAMERA 2.0
- IMG MER
- GreenGenes
- The greengenes web application provides access to the current and comprehensive 16S rRNA gene sequence alignment for browsing, blasting, probing, and downloading.
- MetaPhyller
- Estimating Bacterial Composition from Metagenomic Sequences (linux)
- WebMGA
- Ótimo framework com várias ferramentas online, como ORF_finder e fragGeneScan
- FragGeneScan
- Orf finder tool
Blogs e Tutoriais
- NCBI News
- Biowisdom
- The Bionformatics Blog
- What’s hot in Bioinformatics
- Bionformatics Tools
- Lista de blogs
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- Introdução à estatística básica com R
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- Diversos pacotes de análise Bioinformatica